عمل قسم المياه والصرف الصحي في  تنفيذ أعمال البنية التحتية الخاصة بشبكات المياه والصرف الصحي وشبكات الري وتصريف مياه الأمطار بالإضافة لتشغيلها وصيانتها سواء كان ذلك في المخططات المطورة للقطاع الخاص أو الجهات الحكومية. وكما يقوم القسم بإنشاء خزانات المياه الإستراتيجية والمحطات وكافة الأعمال الميكانيكية المتعلقة بهذه المشاريع  ويقوم القسم باعتماد المخططات التنفيذية من الجهات المعنية واعتماد المواد وتقديم عينات وفحصها إن لزم الأمر مع جهاز الإشراف الحكومي  المختص كما يمكن تلخيص أعمال تنفيذ شبكات المياه والصرف الصحي والخطوط الناقلة للمياه في التالي: